Počítače slouží nemocným. Hledají, jak vyléčit rakovinu

Pomohou jednou počítače vyléčit rakovinu? Vědci se domnívají, že ano.

Ale bude to trvat ještě mnoho let. Jediné, co víme, je, že dostatečný potenciál pro boj s rakovinou a dalšími nemocemi, v sobě skrývají počítače s velkým výkonem.


Právě ty dokáží vědcům nasimulovat tolik potřebné podmínky jak pro vývoj léků, tak pro ztvárnění dějů, které se odehrávají v lidském těle uvnitř buněk.


Například vědci z Ohia používají superpočítače k tomu, aby z nepatrných rozdílů mezi jednotlivými bílkovinami určili odlišnosti mezi zdravými a rakovinotvornými buňkami.

V Seattlu zase odborníci díky superpočítačům zkoumají genové sekvence, které mají více napovědět o vzniku a možné léčbě určitých druhů mozkových nádorů.


V neposlední řadě, v americké Indianě pak experti používají superstroje k vytváření obrovských databází buněčných struktur. Snaží se přitom zjistit, jak spolu různé duhy buněk komunikují a spolupracují.


Svatý grál v léčbě odhalí až počítače


Cílem moderní vědy a superpočítačů je najít jakousi zázračnou kulku, která by vstoupila do lidského těla, nalezla zmutovanou buňku, vybrala si určitou bílkovinu a s její pomocí by zastavila její replikaci, případně ji sama zničila.


Jednou z možností, jak toho dosáhnout, je mít dostatek informací o zmutovaných buňkách a dalších molekulách, které se podílejí na jejím životě.

Vědci z Indiana Univerzity, si myslí, že by jim odpověď mohla dát podrobná analýza desítek až stovek krevních vzorků. V současné době se zaměřili na boj s rakovinou prsu a vkládají do superpočítače desítky gigabytů nových a nových dat.


Chtějí tak přijít na molekulární vztah mezi rakovinotvornými a normálními buňkami. Bez superpočítače by byli podle vlastních slov jako bez rukou. Ve stroji se snaží simulovat další navazující vztahy mezi různými buňkami.


Superpočítače jsou nedokonalé


Vědci stále považují superpočítače za dětské hračky, které jim zatím pomáhají jen částečně. "Pokud se podíváte na kresbu obličeje, uvidíte ji okamžitě. Počítač ale určí barvu a chemické složení obrazu, ale není natolik chytrý, aby viděl tvář," řekl Jake Chen, odborník z Indiana University,


Jaké počítačové novinky současnosti pak vědci oceňují? Pokud pomineme oblast superpočítačů, pak jsou to hlavně věci, které jim pomáhají přenést si práci domů, nebo do kanceláře.


Jsou tak velmi vděční za příchod procesorů s více jádry (čip zpracuje paralelně více požadavků než procesor s jedním jádrem), za rychlé operační paměti (RAM). Za druhé podle deníku PC Plus často pracují s moderními grafickými kartami. Ty tak vyvrací předpoklad, že by sloužily pouze hráčů počítačových gamesek.

Naopak, vědcům pomáhají simulovat komplikované trojrozměrné modely nejrůznějších struktur - například genové sekvence, nebo části bílkoviny.


Grafické karty se stávají druhými počítačovými mozky. Poskytují obrovskou paralelní výpočetní sílu a jejich výrobci (AMD a Nvidia) pro ně dodávají i speciální software a programovací jazyk, který jejich potenciál odemyká i k jiným než právě herním účelům.

"Tradiční léčba je založena na rentgeny či magnetické rezonanci, operaci a nasazení chemoterapie. Novou výzvou je použít počítače k vyladění léčby na konkrétního pacienta podle jeho genetické výbavy," shrnul budoucí přínos počítačů výzkumník Michael A. Freitas z Léčebného centra při Státní univerzitě v Ohiu.